O Museu Caiçara foi fundado em 1982 por Luiz Ernesto Kawall, jornalista e fundador do MIS de São Paulo, e Praxedes Mário de Oliveira, caiçara de Ubatuba. Inicialmente localizado no Sítio Sapé, o museu mudou-se em 1994 para a área do Projeto TAMAR/ICMBIO.
Com estrutura de pau-a-pique construída pela comunidade, o museu preserva a cultura caiçara com objetos como utensílios domésticos, ferramentas, móveis, fotos e documentos antigos. Seu objetivo é guardar, preservar e contar a história caiçara, promovendo o diálogo entre o museu, a comunidade e as escolas.